web中的shell并不是真正的shell,通过后端处理接受命令并过滤,再使用php中的exec调用
界面实现:
1.前端绘制
2.flash动画

1.只能模拟样式
2.exec等调用shell脚本的方式在操作
3.毕

exec，system，··，这些都可以执行shell命令，你可以做个ajax请求，返回命令结果，然后自己调下样式就行了

https://github.com/nickola/web-console/blob/master/src/webconsole.main.php#L9-L32

这个库封装的是 http://php.net/manual/zh/function.proc-open.php

针对题主的更新:

terminal的实现使用的是 https://github.com/jcubic/jquery.terminal