mysql的工作原理我概念很模糊,有以下几个问题

1. 为什么我之前在用php，xampp的时候装了一遍mysql，现在用node，npm又装了一遍mysql，最后连接数据库时，连接到的是同一个数据库。我猜这是因为mysql端口的原因，我只知道它默认的是3306。我想请问一下我电脑里到底是有几个mysql的安装目录？路径在哪里呢？

2. 我用navicat,phpmyadmin同样都访问到了同一个mysql路径，我想知道者的工作原理是怎样的？

3. mac的在文件管理上和linux有什么不同，比如我在提问的时候能不能直接参考linux的系统的解决方案

如上是我的一些问题，希望有能人可以给出解答，我希望最好能告诉我，这些问题的根本是在哪里，最好能告诉我应该看哪些文档才能弄清楚这些问题。